Ozon günümüzde arıtılmış su, kaynak suyu, maden suyu ve yeraltı sularının işlenmesinde yaygın olarak kullanılmaktadır.Ve CT=1,6 genellikle musluk suyu arıtımında uygulanır (C, çözünmüş ozon konsantrasyonunun 0,4 mg/L olduğu anlamına gelir, T, ozon tutma süresinin 4 dakika olduğu anlamına gelir).

Ozonla arıtılmış içme suyu, virüsler, bakteriler ve parazitler dahil olmak üzere patojenik mikroorganizmaları öldürür veya etkisiz hale getirir ve kirlilik nedeniyle su sistemlerinde bulunan inorganik iz kirleticileri ortadan kaldırır.Ozon tedavisi ayrıca hümik asit ve alg metabolitleri gibi doğal olarak oluşan organik bileşikleri de azaltır.Göller ve nehirler de dahil olmak üzere yüzey suları genellikle daha yüksek düzeyde mikroorganizma içerir.Bu nedenle kirlenmeye yeraltı sularından daha yatkındırlar ve farklı arıtma rejimleri gerektirirler.