Kwa sasa, ozoni hutumiwa kwa kawaida katika maji yaliyotakaswa, maji ya chemchemi, maji ya madini na usindikaji wa maji ya chini ya ardhi.Na CT=1.6 mara nyingi hutumiwa kwa matibabu ya maji ya bomba (C inamaanisha mkusanyiko wa ozoni iliyoyeyushwa 0.4mg/L, T inamaanisha muda wa kuhifadhi ozoni dakika 4).

Maji ya kunywa yaliyotibiwa na ozoni huua au kuzima vijidudu vya pathogenic ikiwa ni pamoja na virusi, bakteria, na vimelea na kuondoa uchafu wa athari za isokaboni unaopatikana katika mifumo ya maji kwa sababu ya uchafuzi wa mazingira.Matibabu ya ozoni pia hupunguza misombo ya kikaboni ya asili kama vile asidi humic na metabolites ya algal.Maji ya usoni, yakiwemo maziwa na mito, kwa ujumla yana viwango vya juu vya vijidudu.Kwa hiyo, wao ni zaidi ya kukabiliwa na uchafuzi kuliko maji ya chini ya ardhi na wanahitaji serikali tofauti za matibabu.