Attualmente, l'ozono è comunemente utilizzato nell'acqua purificata, nell'acqua di sorgente, nell'acqua minerale e nel trattamento delle acque sotterranee.E CT=1,6 viene spesso applicato al trattamento dell'acqua del rubinetto (C significa concentrazione di ozono disciolto 0,4 mg/l, T significa tempo di ritenzione dell'ozono 4 minuti).

L’acqua potabile trattata con ozono uccide o inattiva i microrganismi patogeni inclusi virus, batteri e parassiti e rimuove le tracce di contaminanti inorganici presenti nei sistemi idrici a causa dell’inquinamento.Il trattamento con ozono riduce anche i composti organici presenti in natura come l’acido umico e i metaboliti delle alghe.Le acque superficiali, compresi laghi e fiumi, generalmente contengono livelli più elevati di microrganismi.Pertanto, sono più soggetti alla contaminazione rispetto alle acque sotterranee e richiedono regimi di trattamento diversi.